La Educación Básica en el Instituto Pedagógico Nacional comprende las comunidades 4 (6º y 7º) y 5 (8º y 9º), en las que los estudiantes forman su espíritu crítico a partir de lo disciplinar y lo interdisciplinar, formulado a través de los Proyectos Pedagógicos Integrados. Es decir, que la formación en estos ciclos está de acuerdo a lo planteado en la Ley General de Educación en su artículo 22.

De forma particular, es de resaltar el trabajo en los talleres, los cuales son fundamentales para la exploración de habilidades y gustos por parte de los estudiantes. Estos talleres, así como las diferentes asignaturas y áreas, tendrán un papel fundamental en la elección de énfasis en la Educación Media.