La Básica Primaria del Instituto Pedagógico Nacional es una sección conformada por cinco grados: primero, segundo, tercero, cuarto y quinto, y cada uno de estos cuenta con cuatro grupos.

En los grados primero, segundo y tercero los estudiantes son guiados por las maestras de global, quienes tienen a su cargo los espacios formativos de matemáticas, ciencias naturales, ciencias sociales y lengua castellana, de manera articulada. Además, los niños tienen docentes especializados para trabajar las áreas de artes plásticas, lengua extranjera, educación física, música, tecnología e informática, ética, religión y biblioteca.

En los grados cuarto y quinto los estudiantes son acompañados por maestros especializados de todas las áreas y asignaturas a saber: matemáticas, ciencias naturales, ciencias sociales, lengua castellana, artes plásticas, lengua extranjera, educación física, música, tecnología e informática, ética, religión y escuelas deportivas. En este último espacio tienen la posibilidad de experimentar diferentes disciplinas deportivas por medio de pre-deportivos y de socializar con sus compañeros.

Las comunidades 2 y 3 cuentan dentro de su malla curricular con un espacio formativo denominado talleres, el cual brinda a los estudiantes oportunidades de aprendizaje, socialización y exploración vocacional. Adicionalmente, se les ofrecen actividades extraescolares, que les permiten fortalecer sus conocimientos o explorar nuevas oportunidades de aprendizaje.